Kapelu Tublatanka založili v 1982, bola jednou z najprogresívnejších v bývalom Československu. Juraj Černý bol jej bubeníkom a spolu s Martinom Ďurindom ju formovali na základe vzorov ako Led Zeppelin, Deep Purple, či Pink Floyd. Černý s Tublatankou nahral sedem štúdiových albumov, kým ju v roku 1996 opustil. Okrem toho hral ešte v Slobodnej Európe.
Juraj Černý prežil po časoch strávených s Tublatankou búrlivé obdobie ako rockeri mávajú, pred šiestimi rokmi však prispel k tomu, že kapela Slobodná Európa – dnes jedna z autentických a najlepších slovenských skupín – nabrala druhý dych.
Juraj Černý vyštudoval réžiu na VŠMU. V deväťdesiatych rokoch mal problémy s drogami, ktoré však prekonal po intenzívnej liečbe.
Nahral s Tublatankou albumy: Tublatanka (1985), Skúsime to cez vesmír (1987), Žeravé znamenie osudu (1988), Nebo – peklo – raj (1990), Volanie divočiny (1992), Poďme bratia do Betlehema (1993) a Znovuzrodenie (1995). V roku 1996 zo skupiny odišiel.
Bol členom skupiny Slobodná Európa, s ktorou nahral štúdiovky Pakáreň (1991), Unavení a zničení (1994) a Štvorka (2014). Venoval sa tiež písaniu scenárov či réžii.
